شورای علمی پوهنتون، عالیترین مرجع تصمیم گیری پوهنتون طلوع سعادت، دارای وظایف و صلاحیت های زیر میباشد:

1. تصمیم گیری در مورد پیشنهاد رئیس پوهنتون در مورد تعیین معاونان پوهنتون؛
2. طرح پالیسی تحصیلات عالی و تحقیقات علمی پوهنتون و پیشنهاد آن به مراجع ذیصلاح
3. تدوین و ارزیابی برنامه های علمی-تحقیقی؛
4. طرح و پیشنهاد پلان های انکشافی؛
5. نظارت از تطبیق پلان ها و برنامه های آموزشی؛
6. مطالعه و پیشنهاد تاسیس، توسعه، تجزیه، الحاق، ادغام و یا الغای پوهنحی ها و دیپارتمنت ها؛
7. پیشنهاد عقد، تعدیل، تمدید یا فسخ تفاهم نامه ها و قراردادهای توأمیت؛
8. مطالعه و پیشنهاد تدویر برنامه های علمی بالا تر از لیسانس؛
9. اتخاذ تصمیم در مورد پیشنهاد تقرر یا انفکاک عضو کادر علمی؛
10. ارزیابی ترفیع علمی، تثبیت رتب علمی و تصویب آنها؛
11. ارزیابی فعالیت های علمی-اکادمیک پوهنحی های مربوط و ارائه گزارش آن به وزارت تحصیلات عالی؛
12. ارزیابی فعالیت های معاونیت ها، آمریت های نشرات، کتابخانهء مرکزی، مرکز تکنالوژی معلوماتی، مرکز انسجام امور تحقیقات علمی،
13. ایجاد کمیته های اختصاصی و تفویض صلاحیت به آنها؛
14. پیشنهاد طرح و تعدیل لوایح و تصویب طرزالعمل های مربوط؛
15. انجام سایر وظایف و صالحیت های مندرج اسناد تقنینی مربوط و یا ارجاع شده توسط ریاست پوهنتون